Les Diclonius sont des humains mutants possédant des cornes desquelles ils tirent un
pouvoir télékinésique représenté par des "vecteurs" : des bras fantômes s'étirant depuis leur
épine dorsale, munis d'une force dévastatrice. En raison de cela ils sont maintenus en
captivité dans un laboratoire de haute sécurité pour y être étudiés.
Lucy, une diclonius, s'échappe du laboratoire en massacrant les gardes avant d'être touchée à la tête par un sniper qui la précipite dans l'océan. Elle se réveille sur une plage et est secourue par un jeune garçon nommé Kota et sa cousine Yuka. Elle a cependant perdu la mémoire et Kota et Yuka décident de l'héberger chez eux, puis lui donnent un nom : Nyu (le seul mot qu'elle semble capable de prononcer).
La vie de Nyu commence alors avec Kota et Yuka. Une tranquillité hélas de courte durée car
un commando d'élite est dépêché pour retrouver et éliminer Lucy. Après son échec,
le laboratoire emploie deux autres diclonius pour tuer Lucy/Nyu.